Molecular Plant：薏米基因組The Coix genome provides insights into Panicoideae evolution and papery hull domesticationFirst author: Chao Guo; Affiliations: Sichuan Agricultural University (四川農業大學): Chengdu錛 ChinaCorresponding author: Shufeng ZhouCoix is a grass crop domesticated as early as Neolithic era. It is still widely cultivated for both highly nutritional food and medicinal use. However錛 the genetic study and breeding of this crop are hindered by lack of a sequenced genome. Here we report de novo sequencing and assembly of the 1錛619 Mb genome of Coix錛 and annotation of 75.39% repeats and 39錛629 protein-coding genes. Comparative genomics analysis showed that Coix is more closely related to sorghum rather than maize錛 but intriguingly only Coix and maize had a recent whole genome duplication event which was not detected in sorghum. We further constructed a genetic map and mapped several important traits especially the strength of hull. Selection of papery hull (thin錛 easy-dehulling) from the stony one (thick錛 hard-dehulling) in wild progenitors was a key step in Coix domestication. The papery hull makes seed easier to process and germinate. Anatomic and global transcriptome analysis revealed that the papery hull is resulted from inhibition of cell division and wall biogenesis. We also successfully demonstrated that seed hull pressure resistance is controlled by two major quantitative trait loci (QTLs)錛 which are associated with hull thickness and color錛 respectively. The two QTLs were further fine mapped within intervals of 250 Kb and 146 Kb錛 respectively. These resources provide a platform for evolutionary studies and will facilitate molecular breeding of this important crop.薏米是一個在新石器時代就已經被馴化的草類作物。現在，薏米仍作為營養食物和醫藥用途被廣泛種植。然而，由于缺乏全基因組序列，

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對于薏米的遺傳研究和育種阻滯不前。本文中，作者報道了薏米的全基因組草圖，大小約為1.619Gb，其中75.39%為重復序列，共注釋出39629個蛋白編碼基因。比較基因組學分析顯示薏米與高粱的親緣關系要比與玉米的更近，但有趣的是，只有玉米和薏米基因組在近期發生了一次全基因組復制事件，而高粱基因組中並未檢測到。作者進一步構建了一個薏米的遺傳圖譜，並且定位了一些重要的性狀，比如薏米殼的強度。從具有厚而難去殼的堅殼（stony hull）的野生祖先種中選擇薄而易去殼的軟殼（papery hull）是薏米馴化過程中的一個關鍵步驟。具有軟殼的種子更容易加工處理，同時也易于萌發。解剖學和轉錄組分析顯示薏米軟殼是由于細胞分裂和壁生物發生的抑制所導致的。作者還揭示了種子外殼壓力抗性由兩個主要的數量性狀位點QTLs控制，分別與殼的厚度和顏色相關。作者進一步將這兩個QTLs精細定位到了250Kb和140Kb的基因組區域。本文的研究將為薏米的演化研究提供一個平台，並有利于促進該重要作物的分子育種。通訊：週樹峰（https://maize.sicau.edu.cn/info/1014/1320.htm）個人簡介：1995-1997年，天津農學院，大專；2000-2003年，四川農業大學，碩士；2003-2006年，中科院植物研究所，博士。研究方向：玉米、薏仁米等作物的遺傳育種研究。doi: https://doi.org/10.1016/j.molp.2019.11.008Journal: Molecular PlantPublished date: November 24錛 2019對“量子”的認識與發展什麼是“量子”？經典物理學，以“絕對時間”觀念，認為時間與“參考系”無關，僅以3維空間矢量表達各種物理量。“時間”只是各維空間量的參變量。 一切物體都有質量，與其它物體的作用，

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都可看作其質量集中于其質量中心“一點”的“粒子”。一切電中性物體都是等量正、負電荷彼此中和的結果。一切帶電物體都有相應的電荷量，與其它物體的作用，

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都可看作其電荷量集中于其電荷量中心“一點”的“粒子”。在一定的封閉系統，

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它們的各種能量(動能、位能、結合能)可以轉換，但總量守恆。實際上，它們也都是：“有一定能量的粒子”即：所謂“量子”。 邁克爾遜光學實驗表明：3維空間矢量牽引運動必然的伽利略變換不成立，引起經典物理學的危機，由相對論，打破“絕對時間”觀念，

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採用“閩可夫斯基矢量”，表達物體的時空位置，就很好的地符合實驗，解決了問題。即得出: 時空位置[1線矢]：r(4)[1線矢]={ra[a基矢]錛a=0到3求和}，r0 =ict，虛數符i=(-1)^(1/2)，(標志時軸與各空間軸正交)c=所在介質中光速，t=經歷的時間並表明經典物理學只是在相應介質3維空間的，該粒子速度/光速，可以忽略的近似。類似地，對于由聲子傳送的情況，則：在與空間正交的時軸加上虛數符i乘相應介質3維空間的聲速a*乘由聲子傳送運行的時間t。而狹義相對論就用4維時空矢量，把“量子”擴展為：時軸分量，由3維空間其速度/光速，可以忽略，和不可忽略，的2類。由4維時空矢量的矢算，就認識到：有4、6、12維的各相應不同的動量和力，有各自相應不同的運動質量m與靜止質量m0，的關系式，有不同的能級，電中性粒子在不同能級間躍遷就輻射或吸收聲子，帶電粒子在不同能級間躍遷就輻射或吸收光子。因而，就又有了：聲子、光子，這2類“有一定能量的粒子”即：所謂“量子”。 因一切粒子的運動質量m不可能無窮大，聲子、光子，

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的靜止質量m0，就必然=0。 在不同能級間，、大量m0不=0的，電中性量子，

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躍遷的集體表現，就是相應的振動波，帶電量子，躍遷的集體表現，

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就是相應的電磁波。大量m0=0的，聲子時空相宇，統計的最可幾分布函數，就是聲波，光子時空相宇，統計的最可幾分布函數，就是光波。光子和聲子的運動質量m=0/0錛它們的各相應數值都須由大量同種光子統計形成的光波或聲波的頻率表達為：m(光或聲)=h(光或聲)頻率(c或a*)^2，能量(光或聲)= h(光或聲)頻率，動量(光或聲)= h(光或聲)頻率/(c或a*)，(c或a*)是所在介質的(光或聲)速。現有國際流行的基礎物理理論，因尚無4維時空各類多線矢及其矢算，未能全面、正確認識各量子的不同特性，特別是，把許多大量“量子”的統計幾率特性，誤認為是各個別“量子”的本征特性，而造成種種嚴重錯誤。必須充分重視彌補、糾正，

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國際流行的諸多有關量子的缺陷、錯誤。，